有益微生物能使养殖者在不中断养殖过程的情况下，清除长时间残留于养殖水域底部废物，尤其是老虾池底部积累大量的残余饵料、排泄废物、动植物残体以及有害气体（氨，硫化氢等），使之降解，最终分解为二氧化碳、硝酸盐、硫酸盐等，有效的降低了水中的COD、BOD，使水体中的NO2--N 、硫化物、氨的浓度降低，从而有效的 改善了水质，且能为单细胞藻类为主的浮游植物的 繁殖提供营养物质，促进藻类为主的浮游植物的繁 殖。这些浮游植物的光合作用，又为池内底栖动物、养殖水产动物及有机物的分解提供氧气，从而形成一个良性的生态循环，有利于水产动物的迅速生长。同时由于净水微生物的大量繁殖，在池内形成优势种群，可抑制病原微生物的繁殖，减少疾病发生。

1、光合细菌（PSB）

光合细菌是地球上最早出现的一类能以光作为能源，以CO2和有机物作为碳源，以有机物、氢 气或硫化物为供氢体而繁殖的原核生物的总称。 作用机理是其细胞内含有细菌叶绿素，在无氧和光照条件下，利用水体中鱼虾残饵及排泄物等有机物 进行不产氧的光合作用，合成大量菌体。光合细菌还能利用水体中的硝酸盐或亚硝酸盐，某些种类还可利用硫化物等，从而形成了很强的水质净化能力。研究表明，光合细菌是水体中C、N、S循环的主要参 与者，可以明 显地 改善水质，增加水中的溶氧（CD），降低COD、BOD，降低氨氮、硝氮、硫化物浓度，极大地减少了养殖池塘换水量、换水次数和疾 病发生率。张瑞安在使用光合细菌净化水质防止赤潮的研究对比试验结果表明，使用光合细菌的虾池氨氮降低0.006-0.155mg/L，硫化物降低0.085mg/L，溶解氧提高0.19-0.25mg/L，对虾池防止赤潮十分有利。

2、芽孢杆菌（Bacillus）

芽孢杆菌是一种简单的细菌，是土壤中的优势种群，具有丰富的蛋白酶、脂肪酶、淀粉酶、纤维素酶等。它能强烈的分解碳系、氮系、磷系、硫系污染 物，分解复杂多糖、蛋白质和水溶性有机物；在养殖水环境中能形成优势菌群，其功能优于PSB而有望成为PSB替代品，成为目前净水研究的热点。任保振等、王广军等在温室养鳖池投喂含有蜡质芽孢杆菌的有益微生物，结果降低了水体中的有机污染物化学需氧量、氨氮、亚硝酸氮的含量，池水和底沙中的异养细菌数量明显增加。同时也能降解进入养殖池的有机物，包括鱼的排泄物、残饵饲料、浮游藻类尸体和池底有机淤泥，使之生成硝酸盐、磷酸盐、硫酸盐等无机盐类，避免了有机物在 养殖池的沉积，维持了良好的生态环境。佐贺新闻用枯草芽孢杆菌对海底堆积物、鱼池和养鱼水库的淤泥进行分解净化，收到很好的效果。

3、硝化细菌

硝化细菌属化能自养菌，专性好氧，大多是专性无机型。硝化细菌可分为2个亚群：亚硝化细菌和硝化细菌。亚硝化细菌将水体中的氨氮转化为亚硝酸氮，硝化细菌将亚硝酸盐氧化为对水生动物无害的硝酸氮。硝化细菌广泛应用于水处理与工业化水产养殖系统，在水中会自动形成生物膜，几天后即可成熟。池清理 重新注入水，3d即可检测到生物膜（硝化细菌和一些藻类）的存在，并且很快即表现出很高的去 除氨氮的效率。生物膜使水中氨氮保持稳定且很低的浓度范围。

4、酵母菌

酵母菌是一种来源广、价格低、氨基酸比较全面的单细胞蛋白，蛋白质含量高达46-65%，且富含动物所必需的多种维生素和微量元素，如烟酸、叶酸、维生素B和胆碱等。其菌种主要有啤酒酵母、产朊假丝酵母及饲料酵母。近年来人们亦将其用在处理养殖水体中，并取得了较好的效果。吴伟等利用假丝酵母处理水体中的亚硝酸盐时， 其降解速率达0.036mg/L，并发现水体中的亚硝酸盐的含量，COD和 BOD的比例对其降解速率有影响。吴伟等利用诺卡氏菌及其与酵母菌的融合细胞处理养殖水体时，其氨氮去除 率分别为32%和28% ，并且能大幅度去除水体中的COD等，稳定PH值，提高水中的DO及水体生态环境中微生物和浮游生物的 生物多样性。

5、放线菌

放线菌是广泛分布于自然界的、有分枝倾向的 或能形成分枝菌丝和产生孢子的特殊类型。能够 产生种类繁多的抗生素、维生素和酶。同时在难分解的物质，如纤维素、木质素、甲壳素等的降解中起 重要作用，创造出其他有益微生物增殖的生态环 境。放线菌作为清除者可分解蛋白质、纤维素及其它有机物，某些菌还具有脱除异味（臭味）之功能。 它的生长能改善水的味道并对水源有消毒作用。 王军等研究了海洋放线菌对大黄鱼病原菌的拮抗作用和抗菌谱，所分离、诱变得到拮抗效果较好 的)株放线菌的抗菌谱都很窄，也即是它们对病 原性溶藻弧菌和副溶血弧菌同时具有较强的拮抗作用，对其他供试菌没有拮抗作用或拮抗效果较弱。

6、蛭弧菌

蛭弧菌是 一类攻击、侵染、裂解其它微生物的寄生菌，有类似噬菌体的作用。蛭弧菌在分类地位上属于蛭弧菌属，包括噬菌蛭弧菌、斯托普蛭弧菌、斯塔尔蛭弧菌和未定名的海洋菌株。蛭弧菌对水中细菌有很强的裂解作用，并且还能改善水质的理化指标，同时， 充足的溶氧有利于蛭弧菌裂解病原菌，氧化降解氨氮，净化水体，提高透明度。研究表明，使用蛭弧菌的养殖生态环境中COD、硫化物和氨氮都得到了有效控制，细菌总数减少，鱼类生存环境明显改善，成活率也相应提高，增重效果显著。

7、基因工程菌

运用生物工程技术，采用细胞融合、基因重组技术等遗传工程手段，可以将某种降解污染能力强的微生物的降解基因，转入繁殖能力强，适应性好的受体微生物中，构建出高效的具有广谱降解能力的净水基因工程菌。1968年美国生物学家查克马蒂运用质粒技术把分别降解芳烃、多环芳烃的质粒 结合到降解脂烃的细菌体内，制造出有一种新的 “超级菌种”。在阿拉斯加石油泄漏中，几个小时内 能消除海面污染原油。欧美研究净水基因工程菌 工程微生物已取得巨天成功，但推广仍持谨慎态度，认为它有重组DNA 潜在的危险。国内这方面的报道不多，但是这是今后发展的方向。

8、复合细菌

复合菌剂就用不同菌株的不同特性，将多种微生物菌株培育后复合为复合微生物制剂，以期发挥它们的综合效效果。纽约Alken Murray司生产的美菌方（ Alken Clear F10)，它是由枯草杆菌、绿脓杆菌、史都哲氏假单胞、萤光假单胞、赫米那氏杆菌、亚硝酸单胞菌、硝酸菌等微生物的总称。它能迅速繁殖而成为优势菌，并以其活跃和丰富的酶系统将养殖池多余的残饵、排泄物、动植物尸体及其它有机污染物分解成为CO2和水，从而减轻污 染，净化水质，减少了病害。薛恒平等研制由芽孢杆菌、光合细菌、蛭弧菌等组成的益生菌王，在虾池中每周施用1次，每次按1*10-6的使用量，结 果试验池水质良好，试验组对虾病毒病暴发的时间延迟了10d，产量增加了40%；用于文蛤，使用的3个池塘均未发病，而对照组池塘发病率为30-50%，且试验组池水比对照组池水清澈。